森环森保所在努力完善自身的同时，积极参与国际合作与交流，参与国际履约活动。先后参于了国家外交部、国家林业局等牵头的IPCC谈判、UNFF的谈判、CBD执行专家组工作，CITES公约的履约执行等工作，为国际履约谈判、决策提供了强有力的技术支持。先后主持了“森林生态系统可持续经营”、“森林植被与水”、“气候变化与森林”、“森林保护”等领域的IUFRO和区域性高层次国际会议。每年接待来所交流的美国、英国等20多个国家的学者达40－50人次，参加国际学术会议或交流访问的科技工作者达40-60人次。国际合作项目逐年增加，全所现有国际合作项目经费已占到全所科研总经费的25%左右。在国际森林生态和森林保护研究领域占有重要地位。
　　截至2008年，我所共主持国际合作项目43项，总经费6874.9万元。其中GEF项目4项，经费3570万元；科技部国际科技合作项目2项，经费447万元，中发合作项目1项，经费8万元；双边合作项目35项，经费3087.6万元；国际组织资助4项，经费217.3万元。
1．国际合作与交流的发展过程
　　我所的国际合作项目始于1996年，当时只有两项， 1998-1999年项目有所增长，在研项目数增至7个，进入新世纪是我所国际合作项目快速激增阶段，2001-2003年在研项目数已经达到11项，2004年增至18项，2005-2006年16项，2007 年15项，居全院前列。
2．引进资金改善条件
　　1998-2001年国际合作项目年到所经费平均150万元，到2002年增至381万元，2003年680万，2004年838万元，2005年由于GEF项目“亚洲白鹤及其它国际重要迁徙水鸟迁徙通道与重要湿地的保护”的获准，年到所经费激增至1705万元，2006年仍保持在812万元的较高水平，2007-2008年维持680万。
　　总的来说，十年来我所的国际合作项目经费在科研经费中占有较大比例，平均占科研经费的1/6至1/5，对改善科研条件是一个极好的补充。通过执行国际合作项目，培养和锻炼了一大批年轻科研人员。
3．取得一批科技成果
　　中美合作项目“白蜡窄吉丁的生物防治”发现了3个天敌新种，其中2种天敌已引入害虫入侵地进行了林间释放，正在发挥生物防治作用。对其中重要的天敌种类进行了基础生物学研究，为进一步的生物防治计划奠定了扎实的基础。
4．引进智力加强人才队伍建设
　　1998年起，我所共执行智力引进项目33项，通过税智力引进项目的执行，主要收获是指导在研项目的执行，帮助解决在研项目中的技术难题。另外，通过与外方专家的沟通和筹划，合作召开了一系列国际会议，如被国际林联〔IUFRO〕列入其2000年重大国际学术活动之一的，由国家林业局天然林保护工程管理中心、中国林科院、中国林学会联合主办、由我所和四川省林业科学研究院承办。国家林业局野生动植物保护司、国家林业局国际合作交流中心、中国生态学会、国家自然科学基金委员会、四川省林业厅、意大利国家研究委员会、国际林联、世界自然基金会、国际竹藤组织、UNDP CPR/96/109项目组、王宽诚教育基金会等单位或组织协办的“森林生态系统: 生态、保育与可持续经营”国际研讨会，就是由前面提及的“干旱、半干旱地区抗旱树种选择及提高树木生长和抗逆性”国际研讨会的发展而来的。本次会议于2000年8月15～21日在四川省成都市召开，与会代表有来自德国、挪威、日本、澳大利亚、美国、加拿大、意大利、以色列、尼泊尔、奥地利、韩国、印度、印度尼西亚、南非、马来西亚、瑞士、瑞典、世界自然基金会、世界银行、国际竹藤组织、国际林业研究所、国际林联、中国共23个国家或组织共计113人，会议报告交流论文108篇。意方是本次会议的主要协办单位之一。2008年度由我所和北京林业大学林学院联合承办的“第七届全国化学生态学学术研讨会”邀请了美国、瑞典、捷克、日本以及国内近60家企业和单位的224名代表参加了此次大会。会议特邀国际著名化学生态学专家，美国Cornell大学Wendell Lee Roelofs教授等7名国外专家以及国内中国科学院动物研究所康乐研究员等知名专家作了大会报告。本次会议内容基本囊括了我国在化学生态学科领域方向的最新研究成果，为推动中国化学生态学研究走向世界打下了良好的基础。
　　由国家林业局对外合作项目中心、中国林业科学研究院和GEF气候变化有关的目标研究林业项目组共同主办、中国林业科学研究院森林生态与环境研究所承办的“气候变化与森林问题”国际研讨会，本次研讨会邀请了多位国际著名的有关气候变化和森林问题权威科学家以及国内从事该领域研究的知名专家参做了精彩的主题发言，包括政府间气候变化委员会（IPCC）前主席、世界银行环境与社会可持续发展部主任Robert Watson博士，世界银行生物碳基金高级咨询专家Ian Noble博士，千年生态系统评价项目能力建设协调员、GEF项目科技咨询委员会副主席、澳大利亚国立大学教授Habiba Gitay博士。我们邀请的国际著名科学家、英国皇家科学院院士、英国爱丁堡大学Jarvis教授就森林作为碳汇在缓解气候变化中的作用问题和气候变化对森林影响作了1个小时的主题发言。
5．提高国际声誉
　　多年来我所积极支持国家林业重大国际活动。组织专家参与了外交部、国家林业局等牵头的国际履约等活动，其中，作为IPCC专家组成员多次参与国际谈判，派员支持“亚太森林恢复和可持续管理网络”的日常工作，参加CBD执行专家组工作，CDM理事会会议，为我国参与未来承诺期LULUCF谈判提供了对策建议。多年参与联合国森林论坛UNFF谈判，负责蒙特利尔进程“温带及北方森林保护与可持续经营的标准与指标”技术组和工作组中国的日常工作。
　　通过参与上述活动、执行国际合作项目和参加重要国际会议，培养出一批在国际项目领域有一定影响的专家，提高了我所的声誉，累计有9人在国际组织中担任17个职务。