1995年3月，林业部下发“关于命名第一批林业部重点开发性实验室的通知”林科通字[1995]28号文件，其中将原森环所森林生态环境实验室和原森保所森林保护学重点实验室正式命名为“中华人民共和国林业部重点开发实验室”。

　　多年来，森林生态环境重点实验室和森林保护学重点实验室始终紧紧抓住生态学科和森林保护学科的国际前沿和生产实际问题，围绕我国森林生态环境保护与建设中的重大科学问题，开展了多尺度、多学科和不同尺度的生态学和森林保护学研究，为提高全社会对森林的地位与作用的认识，促进国家生态保护遇见社的决策提供了重要科学支持。

　　实验室下设有机分析（配置：气-质联用仪、液-质联用仪、气相色谱仪、高压液相色谱仪、全自动氨基酸分析仪、离子色谱仪及有机化学处理间）、无机分析（配置：原子吸收光谱仪、等离子体发射光谱仪、紫外-可见分光光度仪、全自动凯氏定氮仪、全自动原子荧光光度仪以及三个设施齐全的化学与物理处理间）、生物化学（配置：温度梯度PCR仪、普通PCR仪、高端凝胶成像系统、酶标仪、各种高倍体视、倒置、荧光及一般生物显微镜、高压灭菌装置、超速及高速冷冻离心机、二氧化碳临界点干躁仪、超净工作台、多台植物生长培养箱及设施完备的养虫间和组培间）、天敌昆虫、病虫害监测等实验室。研究所从人力、基础设施等各个方面全力支持实验室的工作。经过十多年持续不断的发展完善，实验室现有原子吸收光谱仪(美国)、等离子体发射光谱仪(美国)、全自动氨基酸分析仪(美国)、全自动凯氏定氮仪（意大利）、二氧化碳临界点干燥仪（加拿大）等5万元以上的主要仪器设备45台套，其中原子吸收光谱仪(美国)等90%以上的仪器是进口的高质量仪器设备。本实验室一直遵循“开放、流动、竞争”的原则。全年科研实验工作量约5万人时。实验室总使用面积900平方米，可同时容纳100人进行生态、生物及化学实验。

　　实验室可承担土壤、植物、大气、水等多种样本中无机及有机组分分析，也可进行各类生物学试验。

　　重点实验室建立了“制度化、规范化、科学化”的开放式运行管理模式，实行实验物资和仪器设备等各类资源的集中管理和共享，利用即将建设的网络化信息管理平台，使实验室的各项工作严格、规范、高效、合理。实验室鼓励科研人员和学生们在技术人员指导下利用实验室资源进行自主学习、自主设计、自主实验和自主分析的个性化、探索性实验项目。